Peran-Peran Metode Flow Cytometry dalam Integrasi Teknik Deteksi Laboratorium

Peran-Peran Metode Flow Cytometry dalam Integrasi Teknik Deteksi Laboratorium

Antibodi monoklonal FACS, pelabelan fluoresen, dan produk Elabscience® dalam kategori Flow Cytometry dimaksudkan untuk membantu berbagai aplikasi laboratorium klinis dan penelitian untuk mendeteksi sel imun, sel darah dan jenis sel lainnya, serta status aktivasi sel secara efisien. Pemilihan produk yang paling sesuai untuk Flow Cytometry akan memudahkan penggunaan flow cytometry sebagai metode avant-gardist dari metode konvensional.

A. Tahapan Umum Flow Cytometry

1. Pengambilan sampel melibatkan pemilihan jaringan, sel, atau darah dan menyimpannya sesuai dengan jenis sampel.

2. Staining sel menggunakan antibodi fluoresen untuk mewarnai sel.

3. Memasukkan sampel ke dalam instrumentasi flowcytometer untuk deteksi dan pengumpulan data menggunakan software/program yang tersedia pada instrumen

4. Analisis data kuantitatif.

5. Evaluasi signifikansi biologis dan medis dari hasil analisis.

Tabel 1. Flow cytometers dari BioSino

Model Kecepatan Konfigurasi Mode Injeksi
SinoCyte Flow cytometer ≥50000 events/s 3 Laser 15 warna –          Pengambilan sampel manual single tube

–          40 tube pengambilan sampel otomatis dengan fungsi pencampuran single sampel

–          96-well plate

ZS-AE7S Clinical Flow cytometer ≥46000 events/s 1 Laser 5 warna –          Pengambilan sampel manual single tube

–          32 tube pengambilan sampel otomatis dengan fungsi pencampuran single sampel

BioCyte Clinical Flow cytometer ≥50000 events/s 3 Laser 15 warna –          Pengambilan sampel manual single tube

–          40 tube pengambilan sampel otomatis dengan fungsi pencampuran single sampel

–          96-well plate

Gambar 1. SinoCyte Flow Cytometer dari BioSino

Gambar 1. SinoCyte Flow Cytometer dari BioSino

B. Antibodi Flow Cytometry

Elabscience® menyediakan berbagai pilihan dye dan target protein intraseluler dan ekstraseluler untuk labelling sampel untuk pengujian Flow Cytometry. Antibodi monoklonal FACS dan teknologi pelabelan fluorescent, antibodi Flow Cytometry (FCM) dimaksudkan untuk membantu mengidentifikasi sel imun dan status aktivasi sel secara efisien. Pemilihan antibodi yang paling sesuai untuk Flow Cytometry dengan penelitian atau kegiatan diagnosis yang akan dilakukan.

Tabel 2. Panel antibodi FCM umum dan target sel deteksi

Subpopulasi Sel Species sampel Target
T Cells Human CD3-PE, CD4-FITC, CD8a-APC
Mouse CD3-PE, CD4-FITC, CD8a-APC
B Cells Human CD3-FITC, CD19-APC
Mouse CD3-FITC, CD19-APC
NK Cells Human CD3-FITC, CD16-PE, CD56-PE
BALB/c Mouse CD3-FITC, CD49b-APC
C57BL/6 Mouse CD3-FITC, NK1.1-APC
Th1/Th2/Th17 Cells Human CD4-Elab Fluor® Red 780, IFN-γ-FITC, IL-4-PE, IL-17A-APC
Mouse CD4-Elab Fluor® Red 780, IFN-γ-FITC, IL-4-PE, IL-17A-APC
Treg Cells Human CD4-FITC, CD25-PE, CD127-APC

C. Staining Marker Permukaan

1. Penentuan jenis marker

Penanda permukaan sel: berdasarkan garis keturunan, tahap perkembangan, dan fungsi. Misalnya: penanda permukaan CD4 untuk sel T pembantu.

2. Sifat protein-protein

Marker: reseptor untuk ligan, saluran ion, glikoprotein, dll.

3. Seleksi antibodi dan reagen

Antibodi primer terkonjugasi fluorokrom, antibodi sekunder (jika antibodi primer tidak terkonjugasi), dan buffer pewarnaan.

D. Staining Marker Intraseluler

1. Marker: Proses seluler, seperti ekspresi protein, fosforilasi, dan produksi sitokin

2. Fiksasi: Larutan Fiksasi Jaringan / Paraformaldehyde 4% (dengan DEPC) (E-IR-R114), formaldehida atau aseton 0,01%

3. Permeabilisasi: 0,1–1% NP-40 atau metanol dingin

E. Buffer Spesifik

1. Protein Inti: Foxp3/Transcription Factor Staining Kit (E-AB-F1238C)

2. Protein yang disekresikan (Sitokin): Intracellular Fixation/Permeabilization Buffer Kit (E-CK-A109)

3. Protein Sinyal Terfosforilasi: Fiksasi/Protokol Metanol

F. Siklus Sel

1. Dye fluorescent atau fluorokrom untuk DNA: Propidium Iodide (PI) Solution(750 μM) (E-CK-A165) dan Cell Cycle Assay Kit (Red Fluorescence) (E-CK-A351)

2. Digunakan untuk mengukur jumlah DNA di setiap sel

3. Sel fase S lebih terang dari fase G1

4. Sel fase G2 dua kali lebih terang dari fase G1

5. Catatan: Dye fluorescent lainnya juga dapat digunakan, tetapi harus diperhatikan apakah dye tersebut bersifat permeabel untuk bereaksi dengan DNA. Sel mungkin perlu permeabilisasi dan/atau diperlakukan dengan RNase sebelum staining.

G. Apoptosis

1. DNA sel apoptosis bermigrasi sebagai ladder berukuran 180~200bp pada gel agarosa menghasilkan endonuklease teraktivasi yang memotong DNA genom di antara nukleosom menjadi fragmen-fragmen multimerik berukuran 180~200bp.

2. One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit dapat digunakan untuk mendeteksi apoptosis sel suspensi dan sel adheren dengan teknik flow cytometry.

3. Setelah fiksasi dan permeabilitas, 3′-OH dari DNA rusak dikatalisis oleh Terminal Deoxynucleotidyl Transferase (TdT) dengan fluorescein berlabel dUTP dan dideteksi dengan flow cytometry.

Tabel 3. Kit flow cytometry untuk deteksi apoptosis dari Elabscience®

Katalog Deskripsi
E-CK-A420 One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit (Green, FITC)
E-CK-A421 One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit (Green, Elab Fluor® 488)
E-CK-A422 One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit (Red, Elab Fluor® 594)
E-CK-A423 One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit (Blue, Elab Fluor® Violet 450)
E-CK-A424 One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit (Red, Elab Fluor® 647)
E-CK-A425 One-step TUNEL Flow Cytometry Apoptosis Kit (Red, Elab Fluor® 555)
E-CK-A320 One-step TUNEL In Situ Apoptosis Kit (Green, FITC)
E-CK-A321 One-step TUNEL In Situ Apoptosis Kit (Green, Elab Fluor® 488)

H.    Live/Death Cell

1. Calcein AM/PI Double Staining Kit (E-CK-A354) dapat membedakan sel mati dan sel viable pada mamalia melalui deteksi aktivitas esterase.

2. Calcein AM mampu meningkatkan hidrofobisitas sehingga dapat menembus membran sel hidup dan masuk ke dalam sel. Calcein AM tidak memiliki fluoresensi. Di dalam sel, Calcein AM dihidrolisis oleh esterase endogen untuk menghasilkan Calcein yang dapat berpendar hijau mencolok. Sel mati mempunyai esterase yang rendah, sehingga hanya sel hidup yang mempunyai fluoresensi hijau dengan intensitas tinggi, sedangkan sel mati tidak atau redup.

3. Permeabilitas selektif sel mati akan menghilang, sehingga Propidium Iodide (PI) dapat masuk dan berikatan dengan DNA menghasilkan fluoresensi merah dengan intensitas tinggi.

 

Gambar 2. Produk-produk flow cytometry dapat digunakan juga untuk immunofluorescence imaging

Gambar 2. Produk-produk flow cytometry dapat digunakan juga untuk immunofluorescence imaging

 

E-IR-R321 Immunol Fluorescence Staining Kit (Anti-Rabbit IgG-Cy3)
E-IR-R323 Immunol Fluorescence Staining Kit (Anti-Rabbit IgG-FITC)
E-IR-R325 Immunol Fluorescence Staining Kit (Anti-Rabbit IgG-AF488)
E-IR-R322 Immunol Fluorescence Staining Kit (Anti-Mouse IgG-Cy3)
E-IR-R324 Immunol Fluorescence Staining Kit (Anti-Mouse IgG-FITC)
E-IR-R326 Immunol Fluorescence Staining Kit (Anti-Mouse IgG-AF488)

I. Proliferasi Sel

1. E-Click EdU Cell Proliferation Flow Cytometry Assay dapat digunakan untuk mendeteksi proliferasi sel dengan teknik flow cytometry.

2. Sintesis DNA: metode akurat untuk mendeteksi proliferasi sel.

3. Metode EdU: menggabungkan EdU dan reaksi klik, tanpa menggunakan antibodi, teknik relatif mudah dan sensitivitas tinggi.

4. EdU (5-ethynyl-2-deoxyuridine) (analog timidin) dapat menjadi alternatif pengganti timidin dalam sintesis DNA.

5. Gugus asetilen pada EdU bereaksi dengan probe azida fluoresen (FITC Azide, Elab Fluor® 488 Azide, Elab Fluor® 594 Azide, Elab Fluor® 647 Azide) melalui reaksi katalisis ion tembaga monovalen untuk membentuk cincin triazol yang stabil. Reaksi berlangsung sangat cepat sehingga disebut reaksi klik.

6. Sel yang melakukan proliferasi dapat dideteksi melalui fluoresensi.

Tabel 4. Kit flow cytometry untuk deteksi proliferasi sel dari Elabscience®

Katalog Proliferasi Assay
E-CK-A370 E-Click EdU Cell Proliferation Flow Cytometry Assay Kit (Green,FITC)
E-CK-A371 E-Click EdU Cell Proliferation Flow Cytometry Assay Kit (Green, Elab Fluor® 488)
E-CK-A373 E-Click EdU Cell Proliferation Flow Cytometry Assay Kit (Red, Elab Fluor® 647)
E-CK-A375 E-Click EdU Cell Proliferation Imaging Assay Kit (Green,FITC)
E-CK-A376 E-Click EdU Cell Proliferation Imaging Assay Kit (Green, Elab Fluor® 488)
E-CK-A377 E-Click EdU Cell Proliferation Imaging Assay Kit (Red, Elab Fluor® 594)
E-CK-A378 E-Click EdU Cell Proliferation Imaging Assay Kit (Red, Elab Fluor® 647)

J. Referensi

https://www.elabscience.com/Products-flow_cytometry_antibodies-77.html

https://www.elabscience.com/Products-cell_proliferation_cytotoxicity_viability-159.html